竞争性PCR 是靶基因与参考标准在同一反应管中共同扩增,用参 考标准作对照估计出一种特异性靶DNA或RNA分子的相对含量。竞争PCR 有效地控制了不同反应管间扩增效率的差异。
竞争 PCR 理论基础:
在PCR扩增过程中,PCR产物的量用公式Y= A (1+R)n表示,其Y表示PCR产物的量,A表示初始 模板的量,R表示PCR的扩增效率,n表示PCR的循环 数,当PCR扩增效率相同时,PCR产物的量与初始模 板的量成正比。 — 相似的基因序列,同一引物,相同的引物结合位 点, 扩增效率一致。最终混合PCR产物中,待分析 样本与竞争底物终产物的比值直观地反映了两者初 始状态时核酸含量比值。
多 重 + 竞争 PCR 优势:
1、通量高:每个反应孔内可同时检测10个基因;
2、经济:适合大样本多个基因同时检测,大大缩短了实验周期,提高了实验效率。
3、检测分辨度高:可有效分辨低至15%的表达量差异;
4、重复性好:在对已知浓度RNA进行递增稀释后,进行多重表达分析线性关系好R2>0.99;
5、准确性高:目标/参照基因片段与内对照基因片段间序列基本一致性, 保证终扩增产物真实反应初始模板量比,一个或多个参照基因与检测 基因在同一管内反应,每个基因的表达量都利用竞争性PCR进行精确 测定。