RT-PCR操作步骤
一、RNA逆转录cDNA(反应体系要20ul)依次加入
1、Oligo(dT)加入1ul。
2、RNA(体积即上一步骤计算出来的)
3、剩下的用无Rnase水补齐共12ul 65℃水浴5min。
二、加入逆转录试剂
1、5×Reaction Buffer 4ul
2、Ribolock RNase Inhibiter 1ul
3、10mM Dntp mix 2ul
4、RevertAid m-mul URT 1ul
三、设置仪器,按照说明书设置
1、oligodT:42℃ 60min
2、逆转录:70℃ 5min
3、终止:4℃
附加:cDNA可以跑电泳看一下,取cDNA 1ul加load buffer(看这个是几乘的)混匀,跑电泳,marker用2000的取6ul左右胶板的制作,后面有说明。
四、PCR cDNA扩增目的基因(反应体系是20ul,不够用无菌水补齐)
下面的实验用高压过的枪头和普通高压过的水即可。(所用以下配比物品都要在冰箱中冻存,使用之前离心,甩下来即可。量大的话可以先加样配比,即把所需要的试剂总量计算出后,取出放在ep管中。)
1、加样:①Mix 10ul ②引物 1ul ③cDNA和水总计9ul
2、混匀:小离心机甩一下即可
3、放入PCR仪:PCR仪事先设定条件,反应条件根据mix说明书来设定
4、PCR产物保存:一般在4℃冰箱保存,长时间不用可-20℃冻存。
五、配胶和跑胶:
1、配胶: (水平胶;琼脂糖凝胶)要带手套,TAE有毒。
小胶板8孔的 TAE 25ml 琼脂糖 0.25~0.30g
中胶板25孔的 TAE 50ml 琼脂糖 0.50~0.55g
步骤:称取BIOWEST AGAROSE(琼脂糖)放入配胶专用烧瓶→用配胶专用量筒量1×TAE倒入烧瓶→酒精灯加热(以看到冒泡为准)→将沸腾的液体转移到EB污染区的烧瓶中→加入EB或EB替代(观察颜色不是很深即可,一般小胶板3滴左右)→插梳子→倒入电泳槽(倒胶从一个角倒入防止产生气泡)→待胶凝固30分钟左右拔出梳子进行跑胶(如不马上跑将胶放4℃冰箱保存,防止胶变干)。
2、跑胶:
(1)电泳缓冲液用1×TAE,一般跑5-8次胶后就要重新换电泳缓冲液。
(2)要让缓冲液没过胶。
(3)Marker标记染色体上一个可以被识别的区域,我们用的是2000的(保存在4℃冰箱中):3-6ul单格加入。
步骤:取PCR产物(cDNA)8ul,加入单格上,接通电源,跑胶。(注意:跑胶方向是从负极到正极),当loading Buffer跑到2/3时停止跑胶(大约40分钟),带手套取胶放在照相台上。
六、照相